人体在应激反应时，会激活缺氧诱导因子。缺氧诱导因子，是大多数慢性病的总开关。

作为平衡，人体也会在应激反应时，释放大量的内啡肽。内啡肽可以抑制缺氧诱导因子，可以止痛，进而消炎（通过抑制缺氧诱导因子实现）。

缺氧诱导因子被激活后，会改变人体利用能量的模式，连锁激活磷脂酶、细胞死亡、细胞自噬模式，如果个体有某种物质抑制了磷脂酶，那么，细胞会激活血管生长因子和神经生长因子及端粒酶，向肿瘤癌症转化。如果磷脂酶没有被抑制，那么它将分解细胞膜和细胞核，造成细胞死亡（不是凋亡）。细胞膜被分解为花生四烯酸，再通过环氧化酶或者脂氧合酶二种渠道代谢。分解后产生的神经酰胺，将吸引免疫细胞，结合二种渠道及个体内分泌差异，形成形形色色的慢性病。

人体意识，由显性潜性二种构成，潜意识占九成以上比例，只不过我们不了解它。显性意识，即我们经常认为的自我意识，本质上不过是潜意识的通讯员、联络员，即潜意识的“窗口”、“代理人”、“傀儡”。潜意识通过显性意识观察认知外界，并把传递回来的信息进行分类加工存储运算，然后“指导”显性意识的活动。

潜意识处理显性意识的功能，需要肽类和类似病毒的物质才能完成（用神经物质这个词概括吧）。而这些物质，会被人体肠道内毒素（脂多糖）干扰，也会被错误基因复制（类似病毒复制）干扰，这样形成的潜意识，将发生错乱，人体显性意识表达出来，就是错觉、幻觉幻听幻视。

错误的潜意识，也会导致人体内分泌免疫紊乱，肠道菌群位移，稳定性遭到破坏，进而干扰人体健康。

就是说：情绪和肠道菌群，互为因果，都可以致病。

抑制显性意识，潜意识就会暴露出来，同时产生大量的内啡肽等神经物质。这些物质，结合腐败菌产生的内毒素，结构将发生改变，后果就是上边说过的，幻听幻视。

所以，通过冥想增加内啡肽抑制缺氧诱导因子，进而治疗慢性病的方法，有个前提，就是需要先改变（或者同时改变）肠道菌群，否则容易造成精神疾病！
慢性病病人的肠道菌群，腐败菌比例都超过正常人（中性菌群“叛变”），所以，他们的行为都表现出来或多或少的异常状态。

正常健康人体，肠道益生菌产生的脂磷壁酸占优势。它引发的是细胞凋亡。细胞凋亡不会引起炎症反应，也不会产生多余的代谢垃圾，所以，健康人冥想，很少产生幻觉幻听。

现代医学发现肠道与脑信息交流密切，提出“脑-肠轴理论”。肠道神经系统不是孤立运作的，其与大脑神经系统通过共用一套神经物质而关联，同步响应。

中医有胃不和则卧不安、便秘则腹中嘈杂的说法，心理情绪可以影响胃肠道，反过来，胃肠道也可以影响心理情绪，互相作用。肠道菌群不单单是消化食物，还会影响人体免疫、神经、激素、意识等。