病毒被激活的前提，是它们的“启动子”被肠道菌群中的革兰氏阴性菌产生的内毒素激活，然后病毒才能够进行复制增殖。所以，只有当革兰氏阴性菌大量增殖或者炎症（或者药物，如抗生素）导致革兰氏阴性菌大量死亡时，病毒才活跃。而病毒活跃产生炎症，也可以促使革兰氏阴性菌增殖。这就是所谓的病毒和细菌经常处于“伴生”状态，二者同向，一增俱增，一损俱损。

交感神经兴奋产生的肾上腺素，可以导致肠道炎症反应，造成肠道菌群位移，改变肠道菌群数量种类和比例。肠道菌群中的益生菌，如双歧杆菌，可以抑制病毒和革兰氏阴性菌，防止它们的代谢产物造成的基因甲基化和干扰性的结合，这样就间接抑制了缺氧诱导因子的产生和产生后的活化程度。益生菌的代谢产物，可以产生抗菌肽，主要在肠道潘氏细胞中形成，它们同样可以抑制病毒，杀死细菌，破坏坏死细胞。

中药治疗癌症的好坏，大部分结果，不是中药的原因，而是病人自己的精神原因决定的。如果应激反应弱，结果就是癌细胞凋亡，逐渐好转；如果应激反应强烈，结果就是癌细胞转移，凋亡转化为坏死，加剧癌症发展。可以看出：中药治疗癌症是把双刃剑，如果病人精神状态不好，还不如不服用。

细胞凋亡，与肠道菌群中的所谓益生菌有直接关系。益生菌代谢的脂磷壁酸，可以诱导细胞凋亡。细胞坏死，与肠道菌群中的所谓有害菌有直接关系。腐败菌死亡产生的脂多糖（内毒素），可以激活炎症物质基因的“启动子”，也可以启动隐藏潜伏病毒基因的“启动子”，形成炎症反应。

如果原癌基因被甲基化抑制，p53作用于细胞修复而非细胞坏死，细胞内的端粒酶被活化，那么结果就是个体寿命的延长。这里可以看出：肿瘤癌症和长寿有非常大的相同点，端粒酶都处于活跃状态。区别是原癌基因是否被活化。

我们继续从现象上寻找慢性病的根源。 近几十年慢性病快速增长，前边已经排除了饮食因素为主因的观点（不是主因，但不是无关）。我们再看看还有什么因素： 农村慢性病也迅速增加，无疑和农药化肥的大量使用相关。化肥通过人体肠道菌群代谢，可以合成亚硝酸盐这种致癌致慢性病的物质。然而，亚硝酸盐的作用是分正负的，不同数量会导致不同的结果，或致病或保护人体，所以，它不是主因。 各种农药和添加剂，是不是主因呢？发达国家同样大量使用，他们的慢性病发病率低于我们，可以排除（不是无关）。